广东开平孔雀湖湿地公园动植物品种繁多,具有丰富的生态多样性和极其重要的保护和利用价值。
广东开平孔雀湖国家湿地公园内有野生维管植物113科370属604种,其中包括1种国家重点Ⅱ级保护野生植物,1种珍稀濒危植物;蕨类植物22科34属65种;裸子植物6科16属21中;被子植物85科315属518种。另外广东开平孔雀湖国家湿地公园还有濒危野生动植物种国际贸易公约附录Ⅱ中收录的物种2种。
野生脊椎动物280种33目87科208属,其中国家Ⅰ级重点保护动物1种,国家Ⅱ级重点保护动物19种,省级重点保护动物19种。